Épisode 11 : En territoire ennemi

 
Invitées : John Terry (Dr. Christian Shephard), Julie Bowen (Sarah), Ronald Guttman (Angelo), Monica Dean (Gabriela)

51e jour. Michael assomme Locke et s’en va après Walt. Jack, Locke et Sawyer partent à sa poursuite. Après plusieurs heures de marche vers le nord, ils entendent Michael tirer des coups de feu. 51e nuit. Le pirate qui dirigeait l’équipe qui a enlevé Walt les arrête ; il fait partie des « Autres ». Sawyer lui tient tête et se fait érafler par une balle tirée des alentours (on peut penser que c'est lui qui a tiré et que sa balle a ricoché mysterieusement sur le pirate, mais on ne voit pas le coup de feu et Sawyer n'a pas habituellement la gachette aussi facile). Les « Autres » sont assez nombreux (au moins une quinzaine les cerne) ; le Pirate explique que l’île est à eux, que les survivants sont tolérés, et qu’ils ne doivent pas s’approcher plus que cela. 52e jour. Jack, Locke et Sawyer retournent au camp de la plage. Sans Michael, ils sont 44 survivants et 14 disparus (Walt, Michael, Cindy, Eli, Jed, Nancy et 8 non nommés du groupe de queue).

 
Épisode 12 : Le Baptême

 
Invitées : Neil Hopkins (Liam), Jeremy Shada (Young Charlie), Zack Shada (Young Liam), Sammi Davis (Mrs. Pace), Vanessa Branch (Karen), Craig Young (Director)

52e jour. Charlie se réveille d’un cauchemar. Il tente de reparler à Claire. 52e nuit, il est sur la plage avec le bébé. 53e jour, il demande conseil à Locke et Eko, et se met en tête que le bébé est en danger et qu’il doit être baptisé (par Eko). Hurley et Libby se rapprochent. Charlie lutte contre la tentation d’utiliser la drogue de la statuette ; Locke le surprend avec sa cachette pleine de statuettes et perd la confiance qu’il avait en lui. 53e nuit : Charlie déclenche un incendie, enlève Aaron et veut le baigner dans les vagues pour le baptiser. 54e jour : Claire, rendue dubitative par Charlie, demande à Eko de les baptiser tous les deux ; Locke met les statuettes au coffre. 54e nuit.

 
Épisode 13 : Conflits

 
Invitées : Richard Cavanna (Peter), Finn Armstrong (Arthur), Kim Dickens (Cassidy), Beth Broderick (Diane), Kevin Dunn (Gordy)

55e jour. Jack et Locke s’entendent pour conserver les armes dans le coffre. Jack récupère des médicaments de la tente de Sawyer, ce qui le rend furieux. Jack et Ana-Lucia parlent d’entraîner une petite armée. Quelqu’un tente d’enlever Sun. Au vu de certains éléments suspects, Kate et Sawyer pensent que c’est Ana-Lucia qui est derrière cette tentative, dans le but de motiver les survivants de la plage vers une meilleure défense. Sawyer prévient Locke, celui-ci cache les armes. 55e nuit. Sawyer s’empare des armes. Durant tout cet épisode, il a utilisé ses talents d’arnaqueur pour manipuler Jack et Locke.

 
Épisode 14 : Un des leurs

 
Invitées : Kamari Borden (U.S. Soldier #2), Theo Rossi (Sgt. Buccelli), Clancy Brown (Joe Inman), Thomas Meharey (U.S. Soldier #1), Marc Casabani (Tariq), Lindsey Ginter (Sgt. Austen)

56e jour. Danielle vient chercher Sayid, elle a attrapé un des « Autres » dans un de ses pièges : un certain Henry. Sayid le décroche et Danielle lui tire dessus (avec une arbalète) lorsqu’il essaie de s’enfuir. Sayid le ramène à la station pour l’interroger avec Locke. Il raconte qu’il s’est crashé sur l’île avec sa femme quatre mois auparavant, en ballon. Ils s’étaient installés dans des grottes près des plages au nord de l’île, elle est tombée malade et est morte trois semaines auparavant. Jack lui soigne sa blessure, avant que Sayid ne s’enferme avec lui dans l’armurerie pour le faire parler (le torturer), au grand dépit de Jack. 56e nuit.

 
Commentaire : Locke manque de taper le code à temps : l’alarme hurle, le compteur défile à toute vitesse, passe dans le rouge, et commence à afficher des hiéroglyphes.

 
Épisode 15 : Congés de maternité

 
Invitées : Tania Raymonde (Young Woman)

Aaron a de la fièvre, et Danielle dit qu’il est infecté. Claire commence à se souvenir de ce qui s’est passé lorsque les « Autres » l’avaient enlevée, en particulier qu’il y avait là-bas un vaccin, et que Danielle était là lorsqu’elle s’est enfuie (d’où les égratignures sur ses bras). 57e jour. Elle veut y retourner pour chercher les médicaments pour soigner son fils, et demande à Danielle de l’emmener là où elles se sont battues. Kate les accompagne. En chemin, les souvenirs de Claire se précisent : elle était dans un laboratoire du Dharma initiative, droguée pour être docile, et Ethan, en médecin, lui expliquait qu’il y avait une contamination sur l’île, qu’ils pouvaient sauver son bébé mais pas elle (pas assez de vaccin), si elle acceptait de leur laisser le bébé et de repartir sans lui au camp des grottes. Elle était prête à accepter, et une équipe d’hommes en blancs étaient prêts à opérer pour extraire le bébé, lorsqu'une jeune femme l’a convaincue de changer d’avis et l’a fait échapper. Claire, Kate et Danielle trouvent l’entrée du laboratoire, mais il est désert. Elle y retrouve l’armoire à vaccins, vide. Kate trouve des casiers pleins d’accessoires de théâtre et de vêtements, reproduisant les costumes et les aspects des « Autres » rencontrés sur l’île (qui, jusqu’ici, semblaient un groupe différent du groupe de scientifiques autour de Claire). Claire suspecte que la personne qui l’a aidée pourrait être Alex, la fille de Danielle. 58e jour. Aaron va mieux. Dans l’armurerie, une remarque de Henry ravive avec violence chez Locke sa rivalité d’avec Jack.

 
Commentaire : Tous les flashbacks de Claire se situent après le crash.